MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013205	GAA	2	6	2108642	2108647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_013205	TTG	2	6	2108658	2108663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_013205	GCTTG	2	10	2108676	2108685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5504	NC_013205	GCT	2	6	2108775	2108780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_013205	TCG	2	6	2108792	2108797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_013205	GCC	2	6	2108816	2108821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_013205	TCG	2	6	2108825	2108830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_013205	CG	3	6	2108848	2108853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_013205	TCG	2	6	2108858	2108863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_013205	GA	3	6	2108870	2108875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_013205	CTC	2	6	2108961	2108966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_013205	GAT	2	6	2108970	2108975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_013205	TCCC	2	8	2110185	2110192	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5514	NC_013205	CCA	2	6	2110870	2110875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_013205	CTTT	2	8	2110881	2110888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_013205	GACGC	2	10	2111632	2111641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5517	NC_013205	GTG	2	6	2111645	2111650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013205	GA	3	6	2111709	2111714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_013205	CCT	2	6	2111970	2111975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_013205	GTG	2	6	2112003	2112008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_013205	AGG	2	6	2112009	2112014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013205	CG	3	6	2113161	2113166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_013205	CG	4	8	2113595	2113602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_013205	GAG	2	6	2113610	2113615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013205	TCC	2	6	2115913	2115918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_013205	GAG	2	6	2116024	2116029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013205	CCT	2	6	2117288	2117293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_013205	TGT	2	6	2117304	2117309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_013205	CGC	2	6	2117356	2117361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_013205	AGCC	2	8	2117422	2117429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_013205	TCC	2	6	2119535	2119540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_013205	GAAA	2	8	2119595	2119602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013205	GC	4	8	2121883	2121890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_013205	GGA	2	6	2121912	2121917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013205	GA	3	6	2122873	2122878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_013205	GATG	2	8	2122907	2122914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_013205	TCGAAA	2	12	2122960	2122971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5538	NC_013205	GGC	2	6	2123906	2123911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_013205	GCC	2	6	2123929	2123934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_013205	CT	3	6	2124509	2124514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_013205	TG	3	6	2124548	2124553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_013205	GGC	2	6	2131835	2131840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_013205	GCG	2	6	2133145	2133150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_013205	GGA	2	6	2133162	2133167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_013205	CTC	2	6	2135445	2135450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_013205	GGA	2	6	2135496	2135501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_013205	CCG	2	6	2135533	2135538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_013205	CCT	2	6	2136882	2136887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_013205	CAA	2	6	2137013	2137018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_013205	CT	3	6	2137021	2137026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_013205	TTGA	2	8	2137045	2137052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_013205	AGC	2	6	2137096	2137101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_013205	GC	3	6	2137100	2137105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_013205	GCC	2	6	2138752	2138757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_013205	CGG	2	6	2138761	2138766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_013205	GGC	2	6	2138775	2138780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_013205	TC	3	6	2139818	2139823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_013205	C	6	6	2140116	2140121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5559	NC_013205	GGC	2	6	2140148	2140153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_013205	ACC	2	6	2141037	2141042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_013205	TC	3	6	2141043	2141048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_013205	GTC	2	6	2141053	2141058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_013205	CCGT	2	8	2141102	2141109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_013205	CAAG	2	8	2141113	2141120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_013205	CGC	2	6	2142473	2142478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_013205	GAC	2	6	2142548	2142553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_013205	CGGC	2	8	2142564	2142571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_013205	TC	3	6	2142626	2142631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_013205	GCG	2	6	2142642	2142647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_013205	CGC	2	6	2142660	2142665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_013205	TCGAT	2	10	2142692	2142701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_013205	CCT	2	6	2143154	2143159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_013205	TTA	2	6	2143180	2143185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_013205	GCC	2	6	2143231	2143236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_013205	C	6	6	2148036	2148041	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5576	NC_013205	GC	4	8	2148111	2148118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_013205	ATG	2	6	2148128	2148133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_013205	GAC	2	6	2149062	2149067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_013205	C	6	6	2151678	2151683	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5581	NC_013205	CG	3	6	2151708	2151713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_013205	GC	3	6	2151749	2151754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_013205	CCT	2	6	2154430	2154435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_013205	AGG	2	6	2157946	2157951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_013205	TCC	2	6	2160200	2160205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_013205	TGCG	2	8	2160549	2160556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_013205	CG	4	8	2160573	2160580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_013205	GGGA	2	8	2160665	2160672	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_013205	GTC	2	6	2162288	2162293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_013205	CCA	2	6	2162297	2162302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_013205	CG	3	6	2162320	2162325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_013205	GC	3	6	2162407	2162412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_013205	CCA	3	9	2162431	2162439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_013205	CGG	2	6	2162464	2162469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_013205	CG	3	6	2162482	2162487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_013205	AGA	2	6	2162601	2162606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_013205	GAA	2	6	2162719	2162724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_013205	ACA	2	6	2162743	2162748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_013205	CGAG	2	8	2162749	2162756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_013205	CGG	2	6	2162790	2162795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_013205	TCC	2	6	2162796	2162801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_013205	ATG	2	6	2162829	2162834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_013205	ACG	2	6	2162838	2162843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_013205	CCA	2	6	2162896	2162901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_013205	CTC	2	6	2162973	2162978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_013205	CCCCA	2	10	2165191	2165200	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5607	NC_013205	TTC	2	6	2165218	2165223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_013205	TC	3	6	2165247	2165252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_013205	CGCC	2	8	2165726	2165733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5610	NC_013205	CG	3	6	2165766	2165771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_013205	TCC	2	6	2168396	2168401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_013205	A	6	6	2168428	2168433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_013205	ACGA	2	8	2168504	2168511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_013205	CACCT	2	10	2170153	2170162	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5615	NC_013205	CCT	2	6	2171228	2171233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5619	NC_013205	GGC	3	9	2175494	2175502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_013205	CCT	2	6	2177249	2177254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_013205	TACG	2	8	2178020	2178027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_013205	GGC	2	6	2178037	2178042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_013205	CTC	2	6	2179319	2179324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_013205	CGC	2	6	2179398	2179403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_013205	CG	3	6	2179419	2179424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5626	NC_013205	ACG	2	6	2179490	2179495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_013205	TACC	2	8	2179510	2179517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_013205	ATG	2	6	2179518	2179523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_013205	AGG	2	6	2179558	2179563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_013205	GC	3	6	2182384	2182389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_013205	G	6	6	2184811	2184816	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_013205	CAT	2	6	2186071	2186076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_013205	GCC	2	6	2186092	2186097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5634	NC_013205	ACA	2	6	2186111	2186116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_013205	TCC	2	6	2189651	2189656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5636	NC_013205	CGC	2	6	2189660	2189665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5641	NC_013205	GCC	2	6	2189788	2189793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5663	NC_013205	GC	3	6	2204641	2204646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5664	NC_013205	CGG	2	6	2204673	2204678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5667	NC_013205	TCC	2	6	2205979	2205984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5682	NC_013205	CCCGG	2	10	2223519	2223528	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5753	NC_013205	G	6	6	2251439	2251444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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